Microsoft Innovation Center pokrenut je 2005.godine kao zajednički pilot projekt Microsoft Inc. uz potporu USAID-a (United States Agency for International Development) i hrvatske vlade. Centar služi kao edukacijski centar za osobe zainteresirane za certifikaciju u programiranju i korištenju specijaliziranih Microsoftovih programa. Ponuda programa Microsoftovog inovacijskog centra bazira se na 3 glavna područja potrebna u razvoju softverskih rješenja i kritična za rast ekonomija u razvoju: vještine i intelektualno vlasništvo, industrijska inovacija te partnerstva. Zbog visokog broja ICT diplomanata i lako distupne infrastrukture, Microsoft smatra Varaždin za najbolji primjer dobre prakse u svojem djelovanju na području jugoistočne Europe. Model primijenjem na Varaždin Microsoft je primijenio na sličnim centrima diljem jugoistočne Europe.